1998年末，根據(jù)中國人民銀行省級機構(gòu)改革實施方案，撤銷中國人民銀行福建省分行和福州市分行，中國人民銀行福州中心支行作為福建省會城市中心支行掛牌成立。中國人民銀行福州中心支行和國家外匯管理局福建省分局合署辦公。根據(jù)中央機構(gòu)編制委員會辦公室批復(fù)，中國人民銀行福州中心支行和國家外匯管理局福建省分局為正局級單位，負責(zé)領(lǐng)導(dǎo)和管理福建省貨幣政策、金融穩(wěn)定、金融服務(wù)以及外匯管理等工作。中國人民銀行福州中心支行內(nèi)設(shè)機構(gòu)有29個，其中職能處室22個，黨群工作機構(gòu)5個（有2個與職能處室合署辦公），直屬單位4個。福建省人民銀行系統(tǒng)有省會城市中心支行1家，副省級城市中心支行1家，地市中心支行7家，縣（市、區(qū)）支行60家。中國人民銀行福州中心支行營業(yè)部作為中央銀行對外服務(wù)的窗口，依托中國現(xiàn)代化支付系統(tǒng)（大額支付系統(tǒng)、小額支付系統(tǒng)）、央行會計集中核算系統(tǒng)、人民幣銀行結(jié)算賬戶管理系統(tǒng)等處理中央銀行業(yè)務(wù)，負責(zé)辦理中央銀行再貸款、再貼現(xiàn)、本外幣存款準(zhǔn)備金及財政存款繳存考核、發(fā)行基金、銀行間資金清算、結(jié)算等賬務(wù)核算和人民幣銀行結(jié)算賬戶核準(zhǔn)工作，為轄區(qū)各金融機構(gòu)提供金融服務(wù)。其主要工作職責(zé)是：一、真實記錄、準(zhǔn)確反映金融機構(gòu)資金運行情況，為央行金融決策提供數(shù)字依據(jù)；二、負責(zé)人民幣銀行結(jié)算賬戶管理系統(tǒng)運行監(jiān)控及本轄區(qū)人民幣銀行結(jié)算賬戶核準(zhǔn)；三、負責(zé)金融機構(gòu)本外幣存款準(zhǔn)備金賬戶、財政存款繳存的考核與核算；四、負責(zé)開戶單位金融業(yè)務(wù)往來款項匯劃業(yè)務(wù)、再貸款、再貼現(xiàn)及發(fā)行基金出入庫等業(yè)務(wù)的會計核算工作；五、負責(zé)組織本部門的會計核算業(yè)務(wù)，監(jiān)督開戶單位按規(guī)定報送會計資料，及時編制各類會計報表；六、負責(zé)央行會計集中核算系統(tǒng)運行管理；七、負責(zé)本部及轄區(qū)縣支行網(wǎng)點支付往來的匯劃業(yè)務(wù)及款項的查詢查復(fù)工作。營業(yè)部現(xiàn)有人員19人（其中：女職工16人），內(nèi)設(shè)綜合科、賬戶管理科、聯(lián)行科、核算科四個科。一直以來，營業(yè)部圍繞履行央行金融服務(wù)職能這一中心，以“構(gòu)建文明和諧集體，提升服務(wù)工作層次，支持海峽西岸經(jīng)濟建設(shè)”為工作目標(biāo)，以風(fēng)險管理為核心，通過健全應(yīng)急機制、強化內(nèi)部管理、夯實會計基礎(chǔ)、創(chuàng)新業(yè)務(wù)手段、倡導(dǎo)優(yōu)質(zhì)服務(wù)等提升工作效率和服務(wù)質(zhì)量，促進了各項工作的落實和規(guī)范化發(fā)展，會計核算、聯(lián)行清算等各項業(yè)務(wù)連續(xù) 20 多年保持無重大差錯、無案件、無資金損失，樹起央行窗口文明服務(wù)的新形象。2002年分別被上海分行和福州中心支行授予“女職工雙文明示范崗”榮譽稱號， 2006年獲得中國人民銀行總行級“女職工文明示范崗”榮譽稱號， 2008年被全國婦聯(lián)、第 29屆奧運會組委會、全國婦女“巾幗建功”領(lǐng)導(dǎo)小組授予“優(yōu)質(zhì)服務(wù)迎奧運全國巾幗文明崗”榮譽稱號， 2009年被全國婦聯(lián)、全國婦女“巾幗建功”領(lǐng)導(dǎo)小組聯(lián)合授予“巾幗文明崗”榮譽稱號， 2010年被人民銀行總行評為“十佳女職工文明示范崗”， 2011年被全國總工會授予“全國五一巾幗標(biāo)兵崗”榮譽稱號。